La puerta de al-Hakam II, también llamada Puerta de San Miguel fue construida por el califa que le da nombre durante la etapa de mayor esplendor del califato omeya. Es ésta, la intervenció de al-Hakam II, la más majestuosa ampliación de todas cuantas acontecieron y dieron forma al conjunto monumental que hoy conocemos. Esta puerta, llamada de San Miguel, se sitúa en la fachada occidental frente al Palacio Episcopal. Mostrando la tradicional alternancia de dovelas de ladrillo rojo y piedra caliza, un gran arco de herradura se inscribe dentro de un alfiz. Encima de éste una galería de arcos de herradura ciegos se cruzan.